Flagę przyjęto 24 czerwca 1991 roku. W kolorystyce jest to kontynuacja flag poprzednich, z których historycznie pierwsza była flaga Księstwa Krainy z czasów Wiosny Ludów (1848 rok), nawiązująca do kolorystyki herbu Krainy. Składała się ona z trzech poziomych pasów.
 
W czerwcu 2003 roku parlament Słowenii ogłosił konkurs na propozycję nowej flagi i godła kraju. Zadecydowano, że flaga ma zachować tradycyjne kolory, ale musi też odróżniać się od innych podobnych flag.

Źródło: www.wikipedia.pl